核酸分子大小與瓊脂糖濃度的關(guān)系

（1）DNA分子的大小 在凝膠中，DNA片段遷移距離（遷移率）與堿基對(duì)的對(duì)數(shù)成反比，因此通過(guò)已知大小的標(biāo)準(zhǔn)物移動(dòng)的距離與未知片段的移動(dòng)距離時(shí)行比較，便可測(cè)出未知片段的大小。但是當(dāng)DNA分子大小超過(guò)20kb時(shí)，普通瓊脂糖凝膠就很難將它們分開(kāi)。此時(shí)電泳的遷移率不再依賴(lài)于分子大小，因此，就用瓊脂糖凝膠電泳分離DNA時(shí)，分子大小不宜超過(guò)此值。

（2）瓊脂脂糖的濃度 如下所示，不同大小的DNA需要用不同濃度的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分離。

瓊脂糖濃度與DNA分離范圍

瓊脂糖濃度 /% 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0

線狀DNA大小/kb60-520-110-0.87-0.56-0.44-0.23-0.1

如何選擇瓊脂糖凝膠的濃度來(lái)分離DNA

總體原則是：分子量大的DNA，電泳時(shí)使用濃度較小的凝膠反之亦反。膠濃度越大，電泳速度越??；若膠濃度偏高，可能跑不動(dòng)，條帶縮在一起；若膠濃度過(guò)低，可能跑得太快，同樣分不開(kāi)?？蓞⒖枷旅娴膶?duì)應(yīng)關(guān)系：

凝膠濃度（%） 線性DNA長(zhǎng)度（bp）

0.5 1000～30000

0.7 800～12000

1.0 500～10000

1.2 400～7000

1.5 200～3000

2.0 50～2000