實(shí)驗(yàn)方法原理
磷酸化位點(diǎn)的確定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白質(zhì)被純化,如果可能蛋白質(zhì)要均一;磷蛋白被特異性的化學(xué)或酶反應(yīng)切斷、產(chǎn)生肽混合物,其中含有一到兩個(gè)磷酸肽不同之處在干其分離磷酸肽的策略是為了確定氨基酸序列,定位肽段內(nèi)磷酸化的殘基。上面所述的分離方法, 2D-PP 作圖、 HPLC 或 lMAC 方法,也同樣適宜于微量制備磷酸肽用于確定磷酸化位點(diǎn)。
實(shí)驗(yàn)材料 蛋白樣品
實(shí)驗(yàn)步驟
過去確定磷酸化位點(diǎn)測序最/常用的是逐步化學(xué)降解法,如絲/氨酸和蘇/氨酸磷酸化分析方法、酪/氨酸磷酸化分析方法, 最近,此方法已經(jīng)主要被質(zhì)譜方法所取代 。非放射活性和放射活性磷酸肽測序的方法,這兩種方法可以補(bǔ)充.在某些情況下可以替代質(zhì)譜方法來確定磷酸化位點(diǎn)。非放射活性方法是用于檢測磷酸絲/氨酸和磷酸蘇氨胺,包括β-消除,與巰基乙醇反應(yīng)形成s- 乙基化半胱氨/酸或β-甲基-s-乙基半胱/氨酸,它們很容易以 PTH 衍生物的形式從自動(dòng)測序儀中提取出來。放射活性方法是由 Ceerenkov 計(jì)數(shù)檢測器檢測在 Edman 化學(xué)降解測序僻環(huán)中釋放出的放射性活度。
如果測絲/氨酸或蘇/氨酸磷酸鹽殘基,磷酸鹽被除去,可觀察到32p-磷酸鹽和各自的 PTH衍生物。在酪/氨酸磷酸鹽情況下,磷酸酯鍵更穩(wěn)定,分析的提取物是 PTH 磷酸酪/氨酸。如果得到的磷酸肽的量非常有限,也許不可能用化學(xué)降解法測肽序列,但是在降解循環(huán)后,放射活性從肽中釋放,通常有可能確定肽內(nèi)磷酸化位點(diǎn)。