目前二代高通量測序已經(jīng)成為研究腸道菌群結(jié)構(gòu)常用的一種方法,該方法僅僅可以得到樣本中微生物的種類和相對豐度,但是無法拿到具體菌株。
遠慕生物專注微生態(tài)研究和應(yīng)用,不僅具有二代高通量測序平臺,而且還建立了腸道菌群需氧/厭氧分離培養(yǎng)平臺,為客戶提供高效的需氧/厭氧菌的靶向分離培養(yǎng)服務(wù),幫助客戶獲得特定菌株。
遠慕培養(yǎng)的樣本
人或動物的糞便樣本
土壤、淤泥等環(huán)境樣本
目標菌株
特定數(shù)量的特定菌株,比如一株或兩株菌
樣本保存和寄送
在客戶取樣之前,微基生物為客戶提供厭氧活菌保存液,客戶將采集的新鮮樣本放入?yún)捬趸罹4嬉褐?,寄回到微基生物?br/>
檢測流程
1 首先通過二代高通量深度測序技術(shù),檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。
2 確定樣本中是否存在客戶感興趣的目標菌株。如果存在,進行下一步實驗。
3 在確定目標菌株的相對豐度后,通過查閱文獻和資料,確定目標菌株的培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基。
4 利用特定菌的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,對目的菌株進行培養(yǎng),同時利用96孔板進行大規(guī)模的分離、純化等反復(fù)操作,找到目的菌株。
5 對最終純化好的目的菌株進行菌種鑒定,從基因水平上再次確認目標菌株。
檢測流程示意圖