什么是生物大分子(biomacromolecules)?有的教科書認(rèn)為生物大分子包括核酸、蛋白質(zhì)、糖類和脂質(zhì)等4類物質(zhì),而有的教科書上只提到核酸、蛋白質(zhì)和糖類等3類物質(zhì)。那么究竟如何界定生物大分子的涵義呢?
大分子(Macromolecule)這一術(shù)語最先是由德國化學(xué)家、諾貝爾獎獲得Hermann Staudinger 在1920年首先提出的,專指超過1000個原子組成的化合物稱為大分子。不同的學(xué)科中,對大分子的理解也存在差異,根據(jù)國際理論與應(yīng)用化學(xué)聯(lián)合會(International Union of Pure and AppliedChemistry , IUPAC )推薦的定義,大分子通常是指單個分子通過聚合作用而形成的高分子量的化合物。
生物大分子包括,核酸(多核苷酸)、蛋白質(zhì)(多肽)、碳水化合物(葡聚糖或多糖)和脂類等,由分子量小于500的單體通過聚合作用形成的大分子。此外,有些分子量很大的環(huán)狀分子如血紅素、葉綠素和維生素B12等也統(tǒng)稱為生物大分子。
氨基酸是多肽或蛋白質(zhì)的建筑模塊,有人認(rèn)為由 2~10個氨基酸殘基組成的肽鏈稱為寡聚肽(oligopeptides),由10~100個氨基酸組成的肽鏈叫做多肽(polypeptides),超過100個氨基酸組成的肽鏈稱為蛋白質(zhì),當(dāng)然多數(shù)蛋白質(zhì)是由1條以上的肽鏈組成。但也有人認(rèn)為小于50個氨基酸殘基以下的肽鏈稱為寡聚肽,大于50個氨基酸以上的肽鏈稱為蛋白質(zhì)。所以從某種意義上來說,盡管蛋白質(zhì)有時可以看做是多聚氨基酸即多肽的同義語,但是通常將分子量小于10 000的稱為多肽。
按照20種標(biāo)準(zhǔn)氨基酸殘基的平均分子量為110計算,以50個氨基酸殘基組成的肽鏈稱為蛋白質(zhì)的話,在蛋白質(zhì)水平上,生物大分子的最小分子量也要在5500以上。也有人認(rèn)為,生物大分子指的是作為內(nèi)主要活性成分的各種達(dá)到上萬或更多的,這樣看來,至少要100個氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)才可以稱為生物大分子,如果將分子量大于10 000 的多肽稱為蛋白質(zhì),那么從蛋白質(zhì)水平上來看,10 000就是生物大分子分子量的下限。
核苷酸(或脫氧核苷酸)是構(gòu)成核酸(或脫氧核酸)的建筑模塊,細(xì)胞內(nèi)的核酸主要分為兩類,即核糖核酸(RNA)和脫氧核糖核酸(DNA)。如以大腸桿菌為例,其細(xì)胞內(nèi)只有一種DNA鏈,由幾百萬個核苷酸組成。而RNA種類多達(dá)3000種以上,其分子量差異很大。那么這些核酸分子是不是都可以稱為生物大分子呢?同蛋白質(zhì)一樣,有人認(rèn)為由50個以下的核苷酸組成的核酸稱為寡聚核酸(oligonucleotide),多于50個核苷酸組成的核酸稱為多聚核酸(polynucleotide),核酸也可以稱作是多聚核苷酸的同義語。
如果核苷酸的平均分子量以 300計算,作為生物大分子的核酸的最小分子量也應(yīng)當(dāng)為15000。這里要強(qiáng)調(diào)的是小RNA分子,如微小RNA (microRNA)分子,簡稱miRNA和小干擾 RNA(small interfering RNA),簡稱siRNA,前者是廣泛存在于植物、動物、細(xì)菌和真菌中的一類非編碼的自身基因組產(chǎn)物RNA的統(tǒng)稱,后者是指通過病毒感染或轉(zhuǎn)基因途徑進(jìn)入細(xì)胞中的非自身基因組編碼的 RNA這些小RNA的長度不等,但大都在20~30個核苷酸之間,盡管這些小RNA 具有重要的生理活性和作用,但都不應(yīng)當(dāng)稱為生物大分子,只能歸類于寡聚核酸。
糖類是自然界中分布*、含量最為豐富的一類有機(jī)化合物,單糖是構(gòu)成多聚糖(Polysaccharides)的建筑模塊,而多糖也是自然界中分子結(jié)構(gòu)十分復(fù)za、種類繁多的生物大分子。
和人類生活密切相關(guān)的多糖包括淀粉、糖原、纖維素等,由于組成多聚糖的單糖的種類不同,多聚糖又分為同聚多糖(homopolysaccharides)和za聚多糖(heteropolysaccharides),前者是指由同一種類型的單糖組成如淀粉和纖維素,后者則是指由2種或2種以上的不同類型的單糖組成如粘多糖。
有人將2~6個單糖組成的多聚糖稱為寡聚糖(oligosaccharides),也有人將2~10個單糖組成的多聚糖稱為寡聚糖,寡聚糖的分子量通常在 300~2000之間。盡管多聚糖的分子量也很高如直鏈淀粉的分子量約為10000 ~200000之間,但是通常還是不能像蛋白質(zhì)一樣準(zhǔn)確地確定其分子量,這是因為多聚糖鏈的合成是沒有模板的,且在合成過程中沒有特異性的起始位點(diǎn)和終止位點(diǎn)。
這樣看來,把多糖作為生物大分子,要明確給出其分子量的上限和下限就顯得十分困難了,但是若將超過10個以上單糖組成的多聚糖稱為多糖,那么在糖水平上,作為生物大分子的下限分子量應(yīng)當(dāng)是2000。
脂類是脂肪和類脂的總稱,也是結(jié)構(gòu)和組成十分復(fù)za的生物大分子,為細(xì)胞生物膜的建筑模塊。組成脂類的單體分子不像組成蛋白質(zhì)、核酸和多聚糖的單體分子那樣簡單,但大部分的脂類都包含一個極性(親水)頭部和 1~ 23個非極性(疏水)的脂肪酸尾部,一般來說脂肪酸多為14~24個的偶數(shù)碳鏈,除此之外還有一些不含脂肪酸的脂類如萜類和固醇類等。
與百萬級分子量的蛋白質(zhì)、核酸或多聚糖相比,一些脂類的分子量較小,通常將分子量在 750~1500范圍內(nèi)的脂類不歸為生物大分子行列,這樣看來,在脂類水平上,生物大分子的分子量下限應(yīng)為1500。由于多數(shù)脂類的分子量小于這個數(shù)值,而且不形成大分子化合物,因此有些教科書中不把脂類列入生物大分子之內(nèi)。
由此可見,生物大分子是人們用于區(qū)別化學(xué)高分子,以及體內(nèi)分子量相對較小的有機(jī)分子而提出來的概念性定義。對于蛋白質(zhì)、核酸,多糖以及脂質(zhì)等不同的生物大分子,人們對其分子量的下限均沒有設(shè)定,而且也很難設(shè)定一個統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。
況且,同樣是蛋白質(zhì)、核酸或多糖,其中也存在很多具有重要生物活性和生物學(xué)功能的小分子寡聚體。同時,不少生物大分子是由蛋白質(zhì)、糖類或脂類形成的,諸如糖蛋白、脂蛋白或糖脂等化合物,且核酸本身就含有核糖或脫氧核糖,這些也都可能是造成人們對生物大分子的定義有不同的理解。