許多活性藥物都來(lái)自天然產(chǎn)物,之所以這么叫,是因?yàn)橥ǔV挥形⑸锊拍墚a(chǎn)生復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。類似于工廠的生產(chǎn)線,大型酶復(fù)合物將這些活性劑分子聚合在一起。慕尼黑理工大學(xué)(TUM)和法蘭克福歌德大學(xué)(Goete University Frankfurt)的一個(gè)研究小組已經(jīng)成功地剖開(kāi)了其中一個(gè)分子工廠的基本機(jī)制。
許多活性藥物都來(lái)自天然產(chǎn)物,之所以這么叫,是因?yàn)橥ǔV挥形⑸锊拍墚a(chǎn)生復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。類似于工廠的生產(chǎn)線,大型酶復(fù)合物將這些活性劑分子聚合在一起。慕尼黑理工大學(xué)(TUM)和法蘭克福歌德大學(xué)(Goete University Frankfurt)的一個(gè)研究小組已經(jīng)成功地剖開(kāi)了其中一個(gè)分子工廠的基本機(jī)制。
許多重要的藥物,如抗生素或抗癌活性劑,都是由微生物(如細(xì)菌或真菌)合成的天然產(chǎn)物。在實(shí)驗(yàn)室里,這些天然產(chǎn)物往往根本無(wú)法生產(chǎn)出來(lái),或者需要付出很大的努力。許多這類化合物的起始點(diǎn)是聚酮類化合物。
在一個(gè)微生物細(xì)胞中,如發(fā)光光桿狀菌(Photorhabdus luminescens),它們是通過(guò)聚酮合成酶(PKS)產(chǎn)生這類化合物的。在PKSⅡ型系統(tǒng)的第一階段,為了逐步建立起所需的分子,四種蛋白質(zhì)協(xié)同工作。
在第二階段,它們被進(jìn)一步的酶修飾成所需的天然產(chǎn)物。以這種方式生產(chǎn)的細(xì)菌天然產(chǎn)物的例子包括臨床上使用的四環(huán)素抗生素或抗癌藥物阿霉素。
跨學(xué)科合作
雖然第二階段的改性步驟得到了很好的研究,但到目前為止,對(duì)第一階段的一般功能幾乎沒(méi)有任何見(jiàn)解,在這些分子工廠中,高活性聚酮中間產(chǎn)物與酶復(fù)合物結(jié)合并受到保護(hù),使其不能自發(fā)反應(yīng)。
慕尼黑技術(shù)大學(xué)生物化學(xué)教授邁克爾?格羅爾(Michael Groll)和法蘭克福歌德大學(xué)(Goete University Frankfurt)分子生物技術(shù)教授海爾格?博德(Helge Bode)兩個(gè)工作組合作,現(xiàn)已彌合了這一差距,這些成果發(fā)表在著名的科學(xué)期刊《Nature Chemistry》上。
這些發(fā)現(xiàn)對(duì)活性劑的新合成有啟發(fā)作用
Michael解釋說(shuō):“在這項(xiàng)工作的背景下,我們第一次能夠借助X射線結(jié)構(gòu)分析來(lái)分析II型聚酮合酶的不同伴侶蛋白復(fù)合物,更詳細(xì)地了解了整個(gè)催化循環(huán)。”
“基于這些發(fā)現(xiàn),將來(lái)有可能以有針對(duì)性的方式操縱中樞生化過(guò)程,從而改變基本結(jié)構(gòu),而不是局限于修飾酶,”Helge補(bǔ)充道。
盡管開(kāi)發(fā)改良抗生素和其他藥物還有很長(zhǎng)的路要走,但兩個(gè)課題組都樂(lè)觀地認(rèn)為,現(xiàn)在分子工廠缺失部分的結(jié)構(gòu)和機(jī)制可以解釋了。“我們已經(jīng)獲得了合成新蛋白質(zhì)復(fù)合物的潛力數(shù)據(jù)。”