1. 沒有從結(jié)果反推設(shè)計整個實驗流程
在開始就要考慮你將需要在申請或論文中展示的統(tǒng)計數(shù)據(jù)。所以在你訂購支試劑或者準備細胞前,更為重要的是從結(jié)尾開始去考慮整個實驗流程。這意味著要去理解生物學(xué)的假說,以及選擇哪種統(tǒng)計方法測試該假說是否合理。
正如統(tǒng)計學(xué)家 Frank Anscombe 說過:「重要的是我們能意識到真正的問題所在 ,并且盡我們所能去解決它。而不是另外找一個可以完*但毫不相干的替代問題?!?/p>
理解這些假說以及了解如何測試它們的合理性,可以帶領(lǐng)研究人員們走上從實驗設(shè)計到數(shù)據(jù)分析再到統(tǒng)計測試的康莊大道。作為獎勵,通過為統(tǒng)計測試做準備,您可以預(yù)測出實驗的規(guī)模,從而收集到充足的樣本使您實驗的終結(jié)果更為可信。
2. 未能設(shè)計合適的抗體配色方案
在理解生物學(xué)檢測指標后,可以開始進行配色方案設(shè)計。
這需要多步驟實現(xiàn),首先確認檢測哪些分群,并且確認終的結(jié)果是檢測分群的百分比變化,還是檢測一種或多種標志物的表達。
在此基礎(chǔ)上,了解儀器和配色方案的熒光染料對進一步設(shè)計以減少補償問題和重要通道分辨率的損失。當設(shè)計配色方案時不要遺漏通道或可能用到的染料。同時注意不要在設(shè)計配色方案時顧此失彼。
3. 未能優(yōu)化實驗
優(yōu)化步驟須包括:
A)試劑滴定
在任何流式實驗中所使用的試劑都應(yīng)該進行滴定和優(yōu)化。 這樣做的目的是獲得信噪比和減少背景干擾。
B)PMT 電壓。
光電倍增管(PMT)靈敏度是基于微珠檢測設(shè)置的,這將確保進行實驗的電壓區(qū)間 PMT 的敏感度。
該電壓可根據(jù)特定的細胞/熒光組合進一步進行調(diào)整,從而進一步優(yōu)化檢測靈敏度。
4. 未使用正確的對照
為了成功進行流式實驗分析,需要在確立穩(wěn)健的多色配色方案,確定正確對照和進行重復(fù)性好的分析上花費大量的時間和精力。研究者不想看到他們的發(fā)現(xiàn)不是由于真正的生物學(xué)變化無法被證實,而是由于儀器的問題無法被證實。
除了資源共享實驗室和核心設(shè)備花費大量的時間在儀器質(zhì)量控制上,研究人員也會把質(zhì)量控制結(jié)合進他們的實驗中。質(zhì)量控制管能實現(xiàn)確保實驗之間的 PMT 電壓一致,能確保實驗正確進行并且能確保設(shè)門策略具有說服力。
5. 未能提供顯示或設(shè)門策略的細節(jié)
對于終結(jié)果的展示,重要的是可信度和可重復(fù)性。在展示設(shè)門策略時(即使是在補充材料中),需說明每個區(qū)域是如何設(shè)置的。諸如使用何種對照和是否使用區(qū)域百分比等問題需要進行討論。
如果使用電子數(shù)據(jù),請確保展示了數(shù)據(jù)的任何轉(zhuǎn)換形式,以及這些數(shù)據(jù)是如何持續(xù)應(yīng)用的。避免使用單變量圖(直方圖),確保展示了圖上的數(shù)據(jù)總數(shù),以便理解實驗的量級。
后,不要僅依靠圖片。流式細胞術(shù)數(shù)據(jù)可以是非常量化的數(shù)據(jù),也可以盡可能地使用表格展示數(shù)據(jù)。